R/seuratFunctions.R
convertSeuratToSCE.Rd
convertSeuratToSCE Converts the input seurat object to a sce object
convertSeuratToSCE(
seuratObject,
normAssayName = "seuratNormData",
scaledAssayName = "seuratScaledData"
)
Input Seurat object
Name of assay to store the normalized data. Default
"seuratNormData"
.
Name of assay to store the scaled data. Default
"seuratScaledData"
.
SingleCellExperiment
output object
data(scExample, package = "singleCellTK")
seurat <- convertSCEToSeurat(sce)
sce <- convertSeuratToSCE(seurat)