convertSeuratToSCE Converts the input seurat object to a sce object

convertSeuratToSCE Converts the input seurat object to a sce object

convertSeuratToSCE(
  seuratObject,
  normAssayName = "seuratNormData",
  scaledAssayName = "seuratScaledData"
)

Arguments

seuratObject	Input Seurat object
normAssayName	Name of assay to store the normalized data. Default "seuratNormData".
scaledAssayName	Name of assay to store the scaled data. Default "seuratScaledData".

Value

SingleCellExperiment output object

Examples

data(scExample, package = "singleCellTK")
seurat <- convertSCEToSeurat(sce)
sce <- convertSeuratToSCE(seurat)