R/seuratFunctions.R
convertSeuratToSCE.Rd
convertSeuratToSCE Converts the input seurat object to a sce object
convertSeuratToSCE( seuratObject, normAssayName = "seuratNormData", scaledAssayName = "seuratScaledData" )
seuratObject | Input Seurat object |
---|---|
normAssayName | Name of assay to store the normalized data. Default
|
scaledAssayName | Name of assay to store the scaled data. Default
|
SingleCellExperiment
output object
data(scExample, package = "singleCellTK") seurat <- convertSCEToSeurat(sce) sce <- convertSeuratToSCE(seurat)